Center for Medical Genomics - OMICRON
Toggle navigation
About us
Staff
Techniques
Equipment
Methods
Publications
Projects
Main page
>
Techniques
>
Methods
>
Data analysis
LINKS
Project
Jagiellonian University
Medical College
Data analysis
Galaxy platform for data processing and analysis
Pipelines for data analysis
DNA-Seq
Variant calling – BWA/Bowtie2, GATK, GEMINI
Copy number variations (CNVs) – XHMM
Identification the causative genes for rare disorders – PhenGen
RNA-Seq
Variant calling – STAR, TopHat2, GATK
Differential analysis of microRNA – SHRiMP, DESeq2
Gene fusion detection – TopHat2, ChimeraScan, Chimera
Metagenomics – Amplicon 16S
Biodiversity analysis – QIIME
Taxonomic analysis – QIIME
Proteomics
Trans-Proteomic Pipeline
Biostatistics
Data analysis – R
Relationship inference – KING
LINKS
Project
Jagiellonian University
Medical College
YOUTUBE
TWITTER
YOUTUBE
TWITTER
Site map
Deklaracja dostępności
Center for Medical Genomics - OMICRON
ul. Kopernika 7c
31-034 Kraków
Phone: 12 422 76 84 wew. 58
E-mail:
omicron@uj.edu.pl
© Uniwersytet Jagielloński - Collegium Medicum
Center for Medical Genomics - OMICRON
ul. Kopernika 7c
31-034 Kraków
Phone: 12 422 76 84 wew. 58
E-mail:
omicron@uj.edu.pl
Site map
Deklaracja dostępności
© Uniwersytet Jagielloński - Collegium Medicum
Center for Medical Genomics - OMICRON
ul. Kopernika 7c
31-034 Kraków
Phone: 12 422 76 84 wew. 58
E-mail:
omicron@uj.edu.pl
Site map
Deklaracja dostępności
© Uniwersytet Jagielloński - Collegium Medicum
Center for Medical Genomics - OMICRON
ul. Kopernika 7c
31-034 Kraków
Phone: 12 422 76 84 wew. 58
E-mail:
omicron@uj.edu.pl
Center for Medical Genomics - OMICRON
ul. Kopernika 7c
31-034 Kraków
Phone: 12 422 76 84 wew. 58
E-mail:
omicron@uj.edu.pl
Site map
Deklaracja dostępności
© Uniwersytet Jagielloński - Collegium Medicum
© UJ Collegium Medicum
Ukryj
Wielkość fontu
A-
A+
Nawigacja klawiaturą
Kontrast
Wybierz kolor
czarno-biały
biało-czarny
żółto-czarny
Pokaż linki
Wyczyść ustawienia
Ukryj
Accessibility by WAH
Main page
Site map
About us
Staff
Techniques
Equipment
Methods
Next Generation Sequencing (NGS)
Microarrays
Proteomics
Data analysis
Publications
Projects