Urządzenia badawcze

• sekwenatory następnej generacji – MiSeq (Illumina), GS Junior (Roche)
• skaner mikromacierzy – HiScan (Illumina)
• chromatograf cieczowy sprzęgnięty ze spektrometrem masowym – Velos PRO (Thermo Scientific)
• system do elektroforezy dwuwymiarowej – Dodeca (BioRad)
• PCR w czasie rzeczywistym – CFX384 (BioRad), CFX96 (BioRad), MiniOpticon (BioRad)
• stacje do automatycznego przygotowywania reakcji (bioroboty) – Bravo Liquid Handling System (Agilent)
• aparat do automatycznej izolacji kwasów nukleinowych – Maxwell 16 (Promega)
• aparat do selecji fragmentów DNA – BluePippin (Sage Science)
• Luminometr – Glomax (Promega)
• zestaw do fragmentacji DNA – Bioruptor (Diagenode)
• czytniki kodów kreskowych
• niezbędny sprzęt do obróbki próbek w laboratorium biologii molekularnej stosującym standardy dobrej praktyki laboratoryjnej (DPL)
• w ramach projektu CDT-CARD (https://cdt-card.cm-uj.krakow.pl/) ośrodek OMICRON dysponuje dodatkowo:
  • aparatem do przygotowania bibliotek scRNASeq Chromium iX
  • aparatem Maxwell RSC 48 wspomagającym tworzenie bibliotek do sekwenatora
  • instrumentem do oceny wielkości i ilości nanocząsteczek w próbce (Analizator NanoSight NS300)
  • instrumentem do oceny aktywności metabolicznej komórek Seahorse XFe96 S7800B wraz z czytnikiem Cytation 5
  • ultrawirówką Optima XPN-80
  • instrumentem do wydajnej transfekcji komórek Nucleofector 4D
  • czytnikiem żeli (chemiluminescencja, promieniowanie podczerwone) Odyssey XF
  • sorterem komórek (2 lasery, 6 kolorów) do pojedynczych mikrozbiorników reakcyjnych (płytki, probówki) FACSMelody 2l6c Plate
  • sorterem nanocząsteczek Micro-PLUS Kairos

Przechowywanie próbek

• zamrażarki -80°C
• diuary na ciekły azot
• system znakowania próbek kodami kreskowymi 2D

Analiza i przechowywanie danych

• serwery NAS (Network Attached Storage) 20TB
• serwery obliczeniowe
• środowiska do wirtualizacji
  • prywatna chmura – OpenNebula
  • system kontenerowy – Docker